НДС в электронной коммерции: когда платить и как отчитываться

С 2025 года правила для бизнеса на упрощенной системе налогообложения (УСН) меняются. Теперь интернет-магазины, чей доход за год превысил 60 млн рублей, обязаны уплачивать налог на добавленную стоимость (НДС). Неправильный выбор ставки НДС или просрочка отчетности могут привести к штрафам и блокировке счета.

Разбираемся, кого коснулись изменения, как рассчитывать НДС и как упростить отчетность с помощью кассовых решений.

Что изменилось в законе и как с этим работать
Как считать и уплачивать НДС интернет-магазину на УСН
Как считать НДС на УСН: АТОЛ Онлайн и АТОЛ Pay
Что важно запомнить

Что изменилось в законе и как с этим работать

Федеральный закон № 176-ФЗ внес поправки в Налоговый кодекс РФ. С 1 января 2025 года организации и ИП на УСН обязаны уплачивать НДС, если их доход за предыдущий календарный год превысил 60 млн рублей.

Изменения касаются и тех, кто раньше не сталкивался с НДС: не выставлял счета-фактуры с налогом, не сдавал декларацию и не вел отдельный учет. Теперь эти действия становятся обязательными при превышении установленного порога по доходу.

Вот как это работает:

• Доход до 60 млн руб. Право на освобождение от НДС сохраняется. В этом случае в счетах-фактурах указывается пометка «Без налога (НДС)», книга продаж не ведется, декларация по НДС не подается. 
• Доход от 60 до 250 млн руб. Появляется обязанность начислять НДС. В этом случае можно выбрать пониженную ставку 5% без права на вычет «входного» НДС. Необходимо вести книгу продаж, выставлять счета-фактуры с выделением налога и сдавать декларацию.
• Доход от 250 до 450 млн руб. Можно выбрать пониженную ставку НДС 7%. Остальные условия остаются теми же: ведение книги продаж, оформление счетов-фактур с выделением налога, подача декларации. Вычет «входного» НДС также не предусмотрен при пониженных ставках
• Доход выше 450 млн руб. Предприниматель теряет право на УСН и переходит на общую систему налогообложения с другими ставками и формами учета согласно п. 4 ст. 346.13 НК РФ. Важно отметить, что перейти на ОСНО необходимо с первого числа месяца, в котором произошло превышение лимита.

Важно учитывать, что при выборе пониженных ставок их потребуется применять не менее 12 кварталов подряд, и изменить режим раньше этого срока нельзя.

Также предприниматели могут выбирать стандартную ставку 10% или 20%, с правом принимать к вычету «входной» налог, если им это экономически выгодно, например, при высокой наценке на товар. 

Как считать и уплачивать НДС интернет-магазину на УСН

Для интернет-магазинов на УСН действуют те же правила, что и для других компаний: если годовая выручка превышает установленный лимит, возникает обязанность начислять и уплачивать НДС, а ставка налога зависит от суммы дохода за прошлый год.

Однако есть особенности, которые важно учитывать именно в онлайн-торговле: дата оплаты, расчет суммы и корректное отображение налога в кассовых чеках.

Как рассчитать налог

В интернет-торговле важно учитывать, что моментом начисления НДС считается по ранней дате: дата отгрузки товара или дата поступления оплаты за товар. Этот порядок подтвержден письмом Минфина России от 29 декабря 2014 г. № 03-07-11/68117.

Налог уже включен в ту сумму, которую клиент заплатил на сайте или при получении заказа. Поэтому НДС рассчитывается по формуле «из суммы с налогом»:

• при ставке 5%: НДС = сумма оплаты × 5 / 105;
• при ставке 7%: НДС = сумма оплаты × 7 / 107.

Эти формулы используются при получении предоплаты или аванса. НДС начисляется с поступившей суммы аванса по соответствующей ставке.

Например, если покупатель оплатил 10 500 рублей, то при ставке 5% из них 500 рублей — это НДС. Именно эту часть нужно перечислить в бюджет.

Важно: при ставках 5% и 7% нельзя уменьшить сумму налога за счет расходов или закупок. Вычет входного НДС в этом режиме не применяется. 

Как платить и отчитываться

НДС уплачивается по кварталам, но равными частями в течение трех месяцев после окончания отчетного периода. Срок не позднее 28-го числа каждого месяца. Например, за 1 квартал 2025 года платежи нужно внести до 28 апреля, 28 мая и 30 июня соответственно.

Платеж оформляется через систему Единого налогового платежа (ЕНП). Для этого используется стандартное платежное поручение с нужными кодами. С документами можно ознакомиться здесь.

Декларация подается ежеквартально до 25-го числа месяца, следующего за кварталом. Например, за первый квартал 2025 года отчет нужно сдать до 25 апреля. С 2025 года применяется новая форма декларации, утвержденная приказом ФНС России от 05.11.2024 № ЕД-7-3/989@. В ней появились отдельные строки для ставок 5% и 7%.

Обычно декларация включает титульный лист, раздел 1 (сумма налога к уплате), раздел 3 (расчет налога) и раздел 9 (данные из книги продаж). Остальные разделы заполняются при наличии дополнительных операций. Если интернет-магазин не работал и налог не начислялся, то можно подать нулевую декларацию.

Как считать НДС на УСН: АТОЛ Онлайн и АТОЛ Pay

При переходе на новые условия НДС предприниматели часто сталкиваются с техническими трудностями: не все кассы поддерживают новые ставки, а при ручном вводе ошибок может стать больше. Если ставка указана неправильно или не передана в чеке, предприниматель нарушает требования ФНС.

Избежать таких ошибок поможет тариф Комбо, который объединяет облачную кассу АТОЛ Онлайн и интернет-эквайринг АТОЛ Pay.  В личном кабинете можно настроить ставки НДС, оформить возврат или отправить чек.  Вы выбираете нужную ставку из списка, система рассчитывает налог и передает данные в ОФД и ФНС автоматически.

В АТОЛ Онлайн настройка доступна для всего чека или отдельно по каждой позиции в зависимости от того, как устроена работа магазина. 

В АТОЛ Pay ставка указывается при создании заказа. Достаточно внести данные по товару, цене и количеству. Если вы принимаете оплату через сайт, ставки можно заранее задать через API АТОЛ Pay. Облачная касса АТОЛ Онлайн уже поддерживает пониженные ставки НДС.

Обратите внимание: если чеки формируются автоматически через внешнюю систему, то новые ставки НДС необходимо указать в настройках этой системы, иначе касса не сможет их применить при формировании чеков.

Что важно запомнить

• С 2025 года интернет-магазины на УСН с доходом свыше 60 млн руб. обязаны уплачивать НДС. Можно выбрать стандартные ставки: 10% или 20% — либо альтернативные, пониженные:   5% при доходе от 60 до 250 млн руб. и 7% при доходе от 250 до 450 млн руб.
• При ставках 5% и 7% вычет входного НДС не применяется. Налог рассчитывается из общей суммы, полученной от покупателя, и полностью перечисляется в бюджет.
• При доходе свыше 450 млн руб. за год предприниматель теряет право на УСН и обязан перейти на общую систему налогообложения с другими ставками и формами учета НДС.
• При начислении НДС по новым ставкам обязательно вести книгу продаж, выставлять счета-фактуры с выделением налога и сдавать декларацию.
• НДС уплачивается поквартально, тремя равными платежами, декларация подается до 25-го числа месяца, следующего за отчетным кварталом, по новой форме с отдельными строками для ставок 5% и 7%.
• Для корректного расчета и передачи НДС удобно использовать современные кассовые решения, такие как АТОЛ Онлайн и АТОЛ Pay, которые поддерживают новые ставки и автоматизируют передачу данных в ОФД и ФНС.